中德学院和机械与能源工程学院（SME）已是多年的合作伙伴。双方至今以来在教学领域的合作巅峰无疑就是2009年启动的“4+M卓越工程师”项目。机械与车辆工程专业已设立一年的德语课程，参与课程的本科毕业生可在之后获得中德工程与机械与能源工程学院的双硕士学位。在该项目框架下已与6所德国高校签订本科双学位协议并在2012年至2013年期间共派出62名学生赴德攻读双学位。2013年，“中德机械与能源工程人才培养模式创新实验区”示范项目已开始启动，第一批学生已于2014年9月入学。

另一个工程师联合培养的巅峰之作是，中德学院与卡尔斯鲁厄理工学院合作下，在嘉定校区成立了中德先进制造技术中心。

2014年4月8日，由同济大学中德学院与机械学院共同签署了《中德学院和机械与能源工程学院教师双聘协议》，进一步促进机械工程卓越工程师的培养，加强中德学院与机械学院的合作。

    2014年4月8日协议签署：同济大学校长（左二），德国学术交流中心秘书长Dorothee Rühland女士（左三），中德学院副院长吴志红（左一），同济大学校长助理、机械与能源工程学院院长余卓平（右一）